El expediente contiene los siguientes documentos: Informe de Miguel de Santisteban, sobre si conviene o no establecer el estanco de la quina de Loja (Junio 4 de 1753); Carta del Virrey Manuel Guirior dirigida al Secretario de Indias Fray Julián de Arriaga, expresando su parecer para que se establezca el estanco de la quina de Loja en beneficio del Real Erario (Mayo 15 de 1773); Real Cédula para que se forme una Junta compuesta por los Ministros y el Fiscal de la Audiencia de Santafé, oficiales reales, corregidores y gente práctica con el fin de dar un dictamen sobre la conveniencia o perjuicio de establecer el estanco de la quina de Loja (Enero 20 de 1776); Decreto del Virrey Manuel Antonio Flórez para que se obedezca la Real Cédula anterior y se cite una Junta de Tribunales; Informe de Sebastián José López Ruiz al Virrey comunicándole del descubrimiento e indagación que acaba de hacer de la legítima quina, de igual o mejor calidad que la de Loja, en las proximidades de Santafé. Describe la planta, la semilla y la flor de las dos muestras distintas de quina (A y B)que remite. Solicita se le pida a José Celestino Mutis y a un boticario que realicen pruebas conducentes a demostrar su legitimidad. Igualmente pide que se informe al Rey de su corto servicio realizado (Agosto 12 de 1776); Decreto remitiendo las muestras de quina a Miguel de Santisteban para que exponga sobre su calidad; Informe de Miguel de Santisteban reconociendo como de legítima quina las muestras recibidas, y alabando la superior calidad del paquete A (Agosto 13 de 1776); Decreto remitiendo las muestras de quina a José Celestino Mutis para que exponga sobre su calidad (Agosto 14 de 1776); Informe de José Celestino Mutis reconociendo la calidad del paquete A y asegurando que él ya la había descubierto en los mismos parajes en 1772. Solicita se recojan mejores muestras para realizar experimentos que aseguren su calidad; Decreto para que se tengan presentes los documentos anteriores para la primera Junta de Tribunales sobre el asunto de la quina (Agosto 21 de 1773); Informe de la Junta General de Tribunales sobre el descubrimiento de dos especies de legítima quina que hizo Sebastián López Ruiz en el Monte de Tena. Expresan la necesidad de que López Ruiz vuelva a los dichos montes para recoger mejores muestras con la intención de repartirlas en el Hospital y boticas de la capital, así como en España para comprobar su efectividad. Recomiendan no prohibir el envío de quina hacia España por el grave perjuicio que puede provocar la falta de este medicamento en la península (Agosto 23 de 1773); Pedimento de López Ruiz al Virrey para que se expidan órdenes circulares y providencias en las inmediaciones del Monte de Tena prohibiendo el corte de alizos, azucenos, mayales y grados, árboles de los cuales se extraen las quinas A y B (Septiembre 12 de 1776); Decreto para que el pedimento anterior se una al expediente sobre quinas; Pedimento de López Ruiz al Virrey para que se expidan con prontitud las órdenes circulares en el Monte de Tena y se extiendan a los Montes del Orinoco. Solicita además, el permiso para trasladarse a los lugares mencionados y conseguir nuevas muestras (Septiembre 16 de 1776); Decreto para que se liberen órdenes a las justicias de los lugares propuestos por López Ruiz con el fin de prohibir el corte de los árboles de quina. Además, se ordena al referido López volver a esos parajes y otros más que considere, para corroborar el descubrimiento de quina, por lo que solicita se le brinden los auxilios necesarios para tal fin; Informe de López Ruiz sobre el viaje que realizó para conseguir muestras de las quinas A y B, relacionando los lugares que visitó. Recogió, además, muestras de quina tipo C (Octubre 14 de 1776); Decreto para que el documento anterior se una al expediente de quinas; Certificación de Fray Salvador Salgado, prior del Convento Hospital San Juan de Dios y médico titular, en la que expone los buenos efectos que surtieron las dos muestras de quina en los pacientes de ese hospital (Diciembre 1 de 1776); Decreto para que se una el documento anterior al expediente sobre quinas; Certificación del Protomédico de Cartagena, Francisco Javier Pérez, sobre la administración de la corteza a varios individuos de la Tropa y de las fábricas. Los primeros no tuvieron reacción alguna, los segundos sanaron perfectamente (Marzo 17 de 1777); Carta del Protomédico de Cartagena a Manuel Antonio Gastelbondo remitiéndole muestras de la quina y solicitándole su parecer sobre la misma (Febrero 16 de 1777); Manuel Antonio Gastelbondo responde que, de acuerdo a su experiencia con la quina, no le reconoce ninguna utilidad y conceptúa inutil su uso en esa región (Febrero 25 de 1777); Carta del Protomédico de Cartagena a Juan Pareja remitiéndole muestras de la quina y solicitándole su parecer sobre la misma (Febrero 16 de 1777); Juan Pareja responde al Protomédico de Cartagena, luego de algunos análisis a las muestras, que éstas son de cualidades diferentes a la verdadera quina (Febrero 24 de 1777);Carta del protomédico de Cartagena a Pedro Ramírez remitiéndole muestras de la quina y solicitándole su parecer sobre la misma (Febrero 16 de 1777); Pedro Antonio Ramírez responde al protomédico de Cartagena que luego de administrar la quina a algunos enfermos, no oberservó efecto favorable ni adverso (Febrero 25 de 1777); Carta del Protomédico de Cartagena a Andrés Gonzáles y Estrella remitiéndole muestras de la quina y solicitándole su parecer sobre la misma (Febrero 16 de 1777); Andrés José González y Estrella responde al Protomédico de Cartagena que en una primera administración de quina a algunos enfermos no observó efecto favorable, pero un segundo grupo de enfermos a los que se le administró la corteza sanó sus fiebres perfectamente (Febrero 28 de 1777); Carta del Protomédico de Cartagena a Fray Juan Antonio Gago remitiéndole muestras de la quina y solicitándole su parecer sobre la misma (Febrero 16 de 1777); Respuesta de Fray Juan Antonio Gago al Protomédico de Cartagena, reseñando las 3 experiencias con el uso de la quina. En la primera no surtió efecto y en las dos últimas todos los pacientes sanaron (Febrero 16 de 1777); Carta del Protomédico de Cartagena a Miguel Serrano remitiéndole muestras de la quina y solicitándole su parecer sobre la misma (Febrero 16 de 1777); Miguel José Serrano y Lara responde al Protomédico de Cartagena que luego del reconocimiento de las cortezas, puede asegurar que ninguna de las dos es quina legítima (Febrero 16 de 1777); Carta del Protomédico de Cartagena a Francisco Alaix remitiéndole muestras de la quina y solicitándole su parecer sobre la misma (Febrero 16 de 1777); El licenciado Francisco Alaix responde al Protomédico de Caratagena, que no puede asegurar si la quina es buena o mala, pues en algunos enfermos funcionó y en otros no (Febrero 16 de 1777); Carta del Protomédico de Cartagena a José López remitiéndole muestras de la quina y solicitándole su parecer sobre la misma (Febrero 16 de 1777); José Ramón López responde al protomédico de Cartagena que, luego de analizar las muestras de quina, ésta no es de la mejor calidad (Febrero 26 de 1777); Carta del Gobernador de Cartagena Juan Pimienta, al Virrey Manuel de Flórez, con la que le remite los 9 dictámnes de los médicos y boticarios de esa ciudad sobre sus experiencias con el uso de la quina (Abril 26 de 1777); Decreto para que se una el documento anterior al expediente de la quina (Julio 23 de 1777); Certificación autenticada del doctor Isidro Ortega y Pimentel, Protomédico General del Virreinato del Perú, y del doctor Cosme Bueno, Profesor público de Medicina y Catedrático de Matemáticas, de que la quina traída de Cuenca y la Provincia de Bracamoros surte iguales efectos que la de Loja (Mayo 19 de 1777); Carta del doctor Cosme Bueno a Sebastián López Ruíz, remitiéndole el documento anterior y expresándole que las muestra mas clara, remitida por éste último, es idénticas a la de Loja, aunque por falta de tiempo, no experimenta con ella (Mayo 20 de 1777); Oficio de Sebastián López Ruiz remitiéndole al Virrey la certificación y la carta que le dirigieron desde el Virreinato del Perú sobre la calidad de las muestras de quina (Julio 23 de 1777); Decreto para que se unan los documentos anteriores al expediente sobre las quinas; Pedimento de Sebastián López Ruiz para que se le de testimonio íntegro del expediente seguido por el descubrimiento de las dos especies de quina en el Monte de Tena (Febrero 20 de 1778); Decreto para que se le de a Sebastián López Ruiz lo que solicita en el documento anterior; Certificación autenticada de escribano de que el expediente anterior concuerda con los originales (Abril 4 1778)

Personas que intervienen en la producción del expediente: Vega, Juan de (Doctor). Conde de Chinchón. La Condamine, Charles - Marie de. Santisteban, Miguel de. Pizarro, José Alfonso (Marqués del Villar). Guirior, Manuel de (Virrey Nueva Granada). Flórez, Manuel Antonio de (Virrey de Nueva Granada). Arriaga, Julián de (Fray). Messía de La Cerda, Pedro (Virrey de Nueva Granada). Carlos III. San Martín Cueto, Miguel de. Iturrate, Francisco. López Ruiz, Sebastián José. Merizalde, Miguel de. Mutis, José Celestino. Ugarte, Pedro de. Casal y Maldonado, Benito del. Pey Ruiz, Juan Francisco. Moreno y Escandón, Francisco Antonio. Vergara, Francisco de. Lastra, Nicolás de la. Nariño, Vicente. Revilla, Manuel. Salgado, Salvador (Fray). González y Estrella, Andrés José. Pérez, Francisco Javier (Protomédico de Cartagena). Gastelbondo, Manuel Antonio. Parejas, Juan. Ramírez, Pedro Antonio. Muñoz, Ignacio. Gago, Juan Antonio (Fray). Alay, Francisco. Serrano y Lara, Miguel José. López, José Ramón. Pimenta, Juan. Ortega y Pimentel, Isidro José. Bueno, Cosme. Humac Minoyulli, Francisco. Portalanza, Agustín Jerónimo de. Hermosa, Fernando José de la. Prieto Dávila, Nicolás. Maldonado, Pedro Joaquín. Villalobos, Ambrosio Vicente

Lugares nombrados en el expediente: Santafé. Loja. Cartagena. España. Quito. Portobelo. Virreinato del Perú. Chimbo. Alausi. Cuenca. Guayaquil. Panamá. Cajanuma (Montes). Uritusinga (Montes). Europa. Piura. Loyola (Mina de oro). Zamora (Mina de oro). Cádiz. Lima. Callao. Cabo de Hornos. Sevilla. Roma. Francia. Ayavaca. Guancabamba. Jaén. Riobamba. Angas (pueblo de). Chillanes (pueblo de). Villo (Montañas de). San Antonio. Río Ujiba. Río Juanambú. Berruecos. Pasto.

[Pineda]1853, Sección 5, Volumen 1, p. 206, entrada 8. [Biblioteca Nacional]1935, Tomo I, p. 312, Columna 2, entrada 3. [Palomino]1989: 352. (Descrito bajo la denominación de "Expediente sobre el comercio y desarrollo de la quina de Loja y otros descubrimientos en varios sitios de la provincia de Quito y en parajes cercanos a la capital de Santafé. Incluye conceptos de don José Celestino Mutis y de don Cosme Bueno, médico, profesor de la universidad de San Marcos de Lima. 1778.")