1. [Comissão do cardeal arquiduque inquisidor geral de Portugal enviada aos inquisidores de Goa e partes da Índia para conhecerem o pecado de sodomia, e a ordem que a isto devem guardar.]

2. [Lista e testemunhos de diversas pessoas, acompanhadas de advertência para que se publiquem as ditas testemunhas na forma em que está este documento.]

3. [Ofício aos inquisidores de Goa e partes da Índia dando ordens de como se proceder em caso de morte de cristãos em terras de mouros e gentios.]

4. [Ofício aos inquisidores de Goa e partes da Índia informando que antes da sua morte, o inquisidor geral nomeara para inquisidor deste Santo Ofício o padre frei Tomás Pinto, no lugar do falecido padre frei Gaspar de Melo, e que se deve continuar os negócios do Santo Ofício.]

5. [Ofício aos inquisidores de Goa e partes da Índia lamentando a morte do inquisidor geral, e ordenando que se fizesse um ofício inteiro de defuntos na igreja mais conveniente, e que todos os ministros e oficiais dessa Inquisição estivessem presentes.]

6. [Ofício aos inquisidores de Goa e partes da Índia ordenando que, havendo no Santo Ofício algumas condenações, se dispendem todas em pagamento dos ordenados e despesas da casa, e que para isso seja utilizado o dinheiro do fisco, e que este dinheiro seja utilizado somente para este fim, tratando sobre a presença de cristãos naturais da terra entre os mouros e gentios, inclusive participando das cerimônias, sobre o édito da graça, e sobre a ida do padre prisioneiro Garcia de Faria.]

7. [Ofício aos inquisidores da Índia onde se aponta o que se deve guardar nos assentos do tormento, e se diz que se deve moderar nas sentenças contra a blasfêmia.]

8. [Ofício aos iquisidores de Goa e partes da Índia determinando que se reúna o conselho para decidir como proceder no caso de morte de cristãos em terras de mouros ou gentios.]

9. [Ofício do cardeal arquiduque e inquisidor geral de Portugal aos inquisidores de Goa e partes da Índia avisando o envio de uma provisão liberando a eleição de deputados, ordenando que os presos que abjuraram de "Vehementi" recebam fiança em casa e que se conserte as casas da Inquisição com o dinheiro do fisco.]

10. [Ofício do cardeal arquiduque inquisidor geral de Portugal aos inquisidores de Goa e partes da Índia contendo o Edito de Graça e o perdão geral, dando comissão aos inquisidores para receber a união da Santa Madre Igreja, e reconciliar na Mesa do Santo Ofício os cristãos daquelas partes que se lançaram com os mouros e gentios, sem os condenarem em penitência pública nem em confiscação de bens.] Documento 058

11. [Ofício do cardeal arquiduque inquisidor geral de Portugal aos inquisidores de Goa e partes da Índia contendo o Edito de Graça e o perdão geral, dando comissão aos inquisidores para receber a união da Santa Madre Igreja, e reconciliar na Mesa do Santo Ofício os cristãos daquelas partes que se lançaram com os mouros e gentios, sem os condenarem em penitência pública nem em confiscação de bens.] Documento 067

12. [Ofício do cardeal arquiduque inquisidor geral de Portugal aos inquisidores de Goa e partes da Índia ordenando que se façam visitações nas partes do norte e do sul por haver cristãos novos e judaísmo nestas terras, assim como as fortalezas de Baçaim, Coxim e Malaca, que se tomem cem cruzados do fisco para o aluguél das casas das condenações, entre outros assuntos.]

13. [Ofício do cardeal arquiduque inquisidor geral de Portugal aos inquisidores de Goa e partes da Índia ordenando que se guarde nesta Inquisição o estilo do reino, e que faltando notário tomem um dos clérigos que o rei mandou servir nos arredores, entre outros assuntos.]

14. [Ofício do cardeal arquiduque inquisidor geral de Portugal aos inquisidores da Índia ordenando que se faça mercê aos oficiais e deputados quando se celebrar o auto, que as justiças seculares não lancem mão das fazendas dos mouros e gentios, entre outros assuntos.]

15. [Ofício do cardeal arquiduque, inquisidor geral de Portugal aos inquisidores de Goa e partes da Índia estranhando escrever o inquisidor Rui Sobrinho a uma de raça, afirmando que tal caso se deve escutar e que tenham esta advertência para adiante, comentando sobre a visitação a ser feita no norte de Malaca, entre outros assuntos.]

16. [Ofício do cardeal arquiduque, inquisidor geral de Portugal aos inquisidores de Goa e partes da Índia ordenando que os oficiais que servirão nas visitações não tomem coisa alguma de ninguém, que os convertidos sejam tratados com rigor que se dê assento ao primeiro inquisidor na cadeira da Mesa, entre outros assuntos.]

17. [Ofício do cardeal arquiduque, inquisidor geral de Portugal aos inquisidores de Goa e partes da Índia relatando a sua aceitação ao cargo de inquisidor geral do reino de Portugal, e recomendando que continuem com o serviço para o bom andamento dessa Inquisição.]

18. [Provisão do cardeal arquiduque e inquisidor geral aos inquisidores de Goa e partes da Índia ordenando os a dar pronta execução do Breve do Quinquênio, do papa Sisto V, que permite aos inquisidores, deputados e ministros do Santo Ofício que levem licitamente todas as rendas e distribuições cotidianas de seus benefícios.] Documento 056

19. [Provisão do cardeal arquiduque e inquisidor geral aos inquisidores de Goa e partes da Índia ordenando os a dar pronta execução do Breve do Quinquênio, do papa Sisto V, que permite aos inquisidores, deputados e ministros do Santo Ofício que levem licitamente todas as rendas e distribuições cotidianas de seus benefícios.] Documento 057

20. [Provisão do cardeal arquiduque inquisidor geral de Portugal mandando proibir a impressão dos livros contidos no "Cathalogo dos Livros Proibidos", com pena de excomunhão.]