1. Advertencias o consejos políticos a un ministro regio [Manuscrito]

2. Apuntes para la historia de la ruina de España [Texto impreso]

3. Bulario de la sagrada Religion de la Hospitalidad de San Juan de Dios ... [Texto impreso] : con advertencias y reflexiones en nuestro Idioma Castellano, para su mas perfecta inteligencia ...

4. Chronologia hospitalaria, y resumen historial de la sagrada Religión del glorioso Patriarca San Juan de Dios ... [Texto impreso] :primera parte [ segunda parte] ...

5. Consideraciones sobre las enfermedades de los ojos, observadas en la isla de Cuba durante el año de 1875 [Texto impreso] : memoria leída en la sesión pública del 14 de mayo de 1876 en la Real Academia de las Ciencias médicas, físicas y naturales de La Habana

6. De la ambliopía alcohólica en la Isla de Cuba y de un sistema coadyuvante no descrito, para diagnosticarla [Texto impreso] : memoria dirigida al Congreso Oftalmológico de Nueva York por D. Juan Santos Fernández

7. Ejemplar de todas las posesiones que el Convento del Carmen de Santa María de los Valles en el Arzobispado de Burgos tiene en diferentes términos y razón de su antigüedad y privilegios [Manuscrito]

8. Higiene de la vista [Texto impreso]

9. Historia de la provincia del Santisimo Rosario de Filipinas, China, y Tunquin Orden de Predicadores [Texto impreso] : quarta parte desde el año de 1700 hasta el de 1765

10. Influencia de la bacteriología en el estudio de las enfermedades de los ojos [Texto impreso]

11. Lauros panegiricos, aclamaciones reales, y festivos aplausos en la cononizacion del ... Gran Patriarca de la Sagrada Religion de la Hospitalidad S. Juan de Dios [Texto impreso] : consagrados ... en su convento hospital de Nuestra Señora del Amor de Dios

12. Libro de cortes de cantería [Manuscrito]

13. Un mundo extraño

14. Oracion panegirica al príncipe de los apóstoles San Pedro [Texto impreso] : que en el día 29 de junio del año de 1786 tuvo ... en la Catedral de Manila ...

15. Por D. Iuan Santos de San Pedro, Inquisidor Apostolico ... con Don Iuan Antonio Zapico de Cabreros [sobre que se confirme una sentencia que tiene sobre una pensión solicitada por D. Juan Antonio Zapico]

16. Por el dotor [sic] don Iuan Santos de San Pedro, Inquisidor Apostolico de la ciudad, y Reino de Toledo, Maestrescuela, y Canonigo de la santa Iglesia Primada de las Españas, con don Iuan Antonio Zapico de Cabreros, sobre confirmar la sentencia que dio el señor don Iuan de Mañozca, del Consejo de su Magestad, ... en que reuocò la execucion que se auia hecho por las decursas de una pension de 650 ducados, que dicho don Iuan Antonio supone tener sobre el Canonicato que possee dicho Inquisidor

17. Trastornos del aparato de la visión en las fiebres paludeas y accidentes a que puede dar lugar su ineludible tratamiento por el sulfato de quinina [Texto impreso]

18. Viaje científico [Texto impreso] : correspondencia a la Crónica Médico Quirúrgica de la Habana