1. Apología del método con que han curado los médicos de Lima la epidemia que se ha padecido en ella por todo el estío del presente año de 1818, publicado en la Gazeta del Gobierno del martes 10 de marzo [recurso electrónico] : y contestación a la crítica que contra dicho método dió a luz en la misma Gazeta el miercoles 9 de abril Don Joaquín Solano profesor de la Real Armada / por el D. D. José Manuel Valdes

2. Disertaciones médico quirúrgicas sobre varios puntos importantes [Recurso electrónico] / por el Dr. Don José Manuel Valdés

3. Disertación quirúrgica sobre el cancro uterino que se padece en Lima donde se exponen sus causas generales y particulares, los medios de precaverlo y de curarlo [recurso electrónico] / por el bachiller José Manuel Valdés, cirujano latino de esta ciudad

4. Memoria sobre el cólera morbus, escrita de orden del Supremo Gobierno [recurso electrónico] / por el D. D. José Manuel Valdés

5. Memoria sobre la disentería [recurso electrónico] : sus causas, pronóstico y curación /cpor D. D. J. Manuel Valdés

6. Memorias sobre las enfermedades epidémicas que se padecieron en Lima, el año de 1821, estando sitiada por el Ejército Libertador [recurso electrónico] / por el doctor don don José Manuel Valdes

7. Questión médica sobre la eficacia del bálsamo de Copayba en las convulsiones de los niños, la cual sostendrá baxo los auspicios divinos, para obtener por orden de Nuestro Amado Monarca El Señor Carlos IV, el grado de Bachiller en Medicina [recurso electrónico] / José Manuel Valdes profesor de cirugía

8. Vejamen solemne según estilo de la Universidad de S. Marcos, A.D. Norberto Vega, el día de la conferencia del grado de Doctor en Medicina [recurso electrónico] / D.D. Josepho Emmanuele Valdes